二手質譜儀的質譜分析法主要是通過對樣品的離子的質荷比的分析而實現對樣品進行定性和定量的一種方法。因此，二手質譜儀都必須有電離裝置把樣品電離為離子，有質量分析裝置把不同質荷比的離子分開,經檢測器檢測之后可以得到樣品的質譜圖，由于有機樣品,無機樣品和同位素樣品等具有不同形態、性質和不同的分析要求,所以，所用的電離裝置、質量分析裝置和檢測裝置有所不同。但是，不管是哪種類型的質譜儀，其基本組成是相同的。都包括離子源、質量分析器、檢測器和真空系統。
二手質譜儀主要的使用是別離同位素并測定它們的原子質量及相對品貌。測定原子質量的精度超越化學測量辦法，大約2／3以上的原子的準確質量是用質譜辦法測定的。因為質量和能量的當量關系，由此可獲得有關核構造與核連系能的常識。關于可經過礦石中提取的放射性衰變產品元素的剖析測量，可確定礦石的地質年月。質譜辦法還可用于有機化學剖析，殊是微量雜質剖析，測量分子的分子量，為確定化合物的分子式和分子構造供應牢靠的根據。因為化合物有著像指紋一樣的共同質譜，二手質譜儀在工業出產中也獲得普遍使用。
對高材料進行雜質剖析。可使用于半導體資料有色金屬、建材部分氣體同位本質譜：對不變同位素C、H、N、O、S及放射性同位素Rb、Sr、U、Pb、K、Ar測定，二手質譜儀可使用于地質石油、醫學、環保、農業等部分。